Čeprav vlažilci zraka ponujajo številne prednosti, obstajajo tudi možna tveganja, če se ne uporabljajo pravilno:
Previsoka vlaga: Če vlažilec zraka preveč poveča vlažnost v prostoru, lahko povzroči nastanek kondenza na oknih in stenah, kar lahko povzroči pojav plesni in plesni. Optimalna vlažnost mora biti med 30% in 50%.
Nevarnost bakterij in plesni: Če vlažilnika zraka ne čistite redno, lahko rezervoar za vodo postane gojišče bakterij in plesni. Ko se ti razpršijo v zrak, lahko povzročijo težave z dihanjem, zlasti pri ljudeh z alergijami ali astmo.
Mineralne usedline: vlažilci, ki uporabljajo navadno vodo, lahko razpršijo minerale v zrak, ki se nato usedejo na površine kot bel prah. To težavo lahko rešite z uporabo destilirane vode ali filtra.
Hrup: Nekateri modeli vlažilnikov so lahko hrupni, kar je lahko dražeče, zlasti če se uporabljajo v spalnici. Ultrazvočni vlažilci so običajno tišji od izhlapevalnih in parnih modelov.