Odvisno od sesalnika se uporabljajo različne vrste filtrov. Vhodni filter, ki ščiti motor, in izhodni filter, ki ščiti pred umazanijo, ki prihaja iz naprave.

Vhodni filter

Vhodni filter je izdelan iz umetnih vlaken, najpogosteje iz netkanega materiala. Lovi nečistoče in ščiti motor pred nečistočami. Zamenjava vstopnega filtra ni zapletena. Samo postavite ga v ohišje motorja. Obstaja veliko različnih univerzalnih netkanih filtrov, ki jih morate sami razrezati na velikost.

Izpušni filter

Izpušni filter čisti zrak, ki prihaja iz sesalnika v okolje. Odpravlja neprijetne vonjave in ščiti napravo pred poškodbami.

Hepa filter

HEPA filter spominja na harmoniko, ki poveča filtrirno površino. Ima visoko učinkovitost pri odstranjevanju onesnaževal, do 95-99%. Absorbira tudi najmanjše prašne delce in odpravlja pojav alergenov in mikropolutantov. Sesalniki s tovrstnim filtrom so priporočljivi za alergike in ljudi z imunskimi težavami.

Namen filtra HEPA je zaščititi motor. Razred filtra je definiran z oznakami. Ločimo H13 in H14. HEPA filter v kombinaciji s sintetičnimi vrečkami učinkovito ujame vse alergene in spore.

Večina filtrov HEPA je pralnih, zaradi česar so primerni za ponovno uporabo. Očistiti jih je treba pod tekočo vodo, brez dodajanja detergentov.

Cilindrični filter

Valjasti filter je lahko izdelan iz papirja ali poliestra, odvisno od modela. Papirnati je namenjen za kemično čiščenje sesalnikov. Tisti iz poliestra so primerni za mokro čiščenje. Cilindrične filtre pogosto najdemo v sesalnikih brez vrečke. Dizajn učinkovito pokriva motor, zato zaščita v obliki torbe ni potrebna. Cilindrične filtre je običajno mogoče ponovno uporabiti in jih je treba redno čistiti.